Прим. перев.: в процессе поиска решения проблемы с логированием медленных запросов MySQL наткнулся на довольно познавательную статью. Её автор не только в деталях описывает своё расследование, которое может оказаться полезным для начинающих администраторов, но и попутно пробуждает чувства ностальгии по эпохе VT100.
Краткое содержание:
Журналы медленных запросов важны, поскольку позволяют выяснить, является ли медленный запрос причиной подвисания приложения.
С этим мы сталкиваемся постоянно — например, когда некий умник пытается провести поиск по всем существующим записям базы данных без фильтра. Да, на MacBookPro, пока его владелец потягивает соевый skinny-латте за 10 баксов в модной кофейне в центре Бушуика в Бруклине (хмм… кого-то напоминает), это сработает, но не в production. Ведь там могут быть сотни тысяч записей, если не больше.
Обычно я загружаю production-базу в локальное окружение и запускаю приложение с включенным журналом медленных запросов. Или уговариваю команду эксплуатации включить slow-логи в stage-окружении.
Что ж, пора заканчивать со введением. Вот как MySQL жалуется на невозможность записи в /dev/stderr:
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] mysqld: Can't seek in file '/dev/stderr' (Errcode: 29 "Invalid seek")
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] Could not use /dev/stderr for logging (error 29). Turning logging off for the whole duration of the MariaDB server process. To turn it on again: fix the cause, shutdown the MariaDB server and restart it.
Примечание: хотя термины MySQL и MariaDB используются как взаимозаменяемые, в моем контейнере работает бесплатная MariaDB с открытым исходным кодом. Так что адвокаты Ларри Эллисона могут расслабиться.
В Alpine Linux писать в stdio могут только члены группы tty.
В Alpine только root и tty могут писать в нулевое устройство псевдотелетайпов (PTS).
Поскольку запуск процессов под root — это зло, я попытаюсь наделить соответствующими правами других пользователей (включая того, кто запускает процесс базы данных mysqld в рассматриваемом Docker-контейнере Alpine).
Эта проблема уже ранее обсуждалась на Medium. Приведенные выше шаги базируются на идеях из этого комментария на github.com:
Они вполне успешно работают для Nginx-контейнера на основе Alpine. Однако в случае аналогичного Alpine-контейнера с MariaDB писать slow-логи в /dev/stderr почему-то не получается.
Все дальнейшие шаги, предпринятые мной для анализа данной проблемы, будут подробно документированы. Это пригодится в будущем.
Если вы не являетесь поклонником жанра ужасов и фильмов о зомби, советую пропустить последующие разделы и просто пролистать до конца, ибо они изобилуют ужасными техническими подробностями.
docker-compose run --rm --user=mysql --entrypoint=ash mysql
/ $ groups
mysql tty
Смотрим содержимое Dockerfile:
Отсутствие tty оправдано, поскольку интерактивная работа с контейнером вроде как не предполагается (ведь никто в реальном времени не будет вводить команды в терминале). Скорее контейнеры будут работать в фоновом режиме самостоятельно, без прямого взаимодействия с пользователем. Однако тут есть странность: пользователю без root-прав все равно нужен tty для перенаправления вывода процесса (а, следовательно, и Docker-логов) в stdio.
Проверяем: tty выделен для пользователя без root-прав в docker-compose.yml
/ $ echo "hi" > /dev/stdout
hi
Получилось!
Контейнер запускается под root’ом. Именно root вызывает su-exec для запуска /usr/bin/mysqld от имени пользователя mysql, не имеющего root-прав:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/dev/stderr \
--slow-query-log
Это невозможно сделать из другого контейнера, потому что MySQL уже работает и использует тот же Docker-том, и находящиеся в нем файлы заблокированы MySQL-процессом.
Невозможно параллельно запустить два процесса базы данных, использующих один и тот же Docker-том
Давайте остановим сервис mysql. Затем запустим отдельный контейнер и попытаемся запустить его вручную.
Отлично. Обратите внимание, что:
Ошибка воспроизведена. Всегда хорошо иметь возможность воспроизвести проблему вручную
Вот ее полный текст:
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] mysqld: Can't seek in file '/dev/stderr' (Errcode: 29 "Invalid seek")
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] Could not use /dev/stderr for logging (error 29). Turning logging off for the whole duration of the MariaDB server process. To turn it on again: fix the cause, shutdown the MariaDB server and restart it.
Взято из https://docs.docker.com/compose/reference/run/ :
-T Disable pseudo-tty allocation. By default `docker-compose run` allocates a TTY.
Кроме того, как говорилось выше, даже если процесс базы данных запускает пользователь без root-прав, сам контейнер работает под root при запуске с помощью docker-compose up -d. Так что tty в таком контейнере в любом случае должен присутствовать (на всякий случай я дополнительно внес в compose-файл соответствующую строку).
Поиск по кодам системных ошибок в MariaDB не дает результата:
/ # chmod o+w /dev/stdout /dev/stderr
Напомню, что у нас Alpine, и /dev/stderr — это не просто /dev/stderr. Это ссылка, которая указывает на ссылку. Да, именно это я и хотел сказать:
«Но /dev/stdout ссылается на /proc/self/fd/1, который, в свою очередь, обычно ссылается на /dev/pts/0 или нечто подобное. Меняются именно разрешения для этой директории. В Linux, как правило, только root:tty может писать в /dev/stdout напрямую».
Что ж, проверим:
Видно, что stdio ссылается на файловые дескрипторы, а файловые дескрипторы ссылаются на нулевой pts
И еще одна попытка:
Может ли tty читать/писать в pts/0?
Увы:
Взято из https://docs.docker.com/config/containers/logging/ :
Создаем ссылку:
ln -sf /dev/stderr /tmp/err.log
Попробуем еще раз, на этот раз указывая на ссылку, а не на stderr напрямую:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/tmp/err.log \
--slow-query-log
Снова пытаемся писать slow-логи в /tmp/err.log (напомню, err.log указывает на stdio). Но все равно не получается:
Пишем в ссылку, указывающую на stdio
А вот если указать реальный файл в директории, в которую пользователь без root-прав может писать (tmp), тогда все в порядке:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/tmp/errordotlog \
--slow-query-log
С обычным Unix-файлом все работает просто отлично!
Вот файл slow-логов и его содержимое
Любопытно.
Самое время для разнообразия совершить небольшой экскурс в историю...
TTY — сокращение от TeleType (телетайп). Их история гораздо богаче, чем может показаться, но достаточно разбить телетайпы на три большие исторические категории:
1. Телетайпы. Электромеханические устройства для кодирования, передачи, декодирования и печати сообщений на больших расстояниях с использованием телеграфии.
Источник: Wikipedia
2. Телетайпы с аппаратной эмуляцией. Устройства-эмуляторы обычных телетайпов, в которых мониторы заменили обычные бумажные рулоны. Пример — Терминал VT100:
Терминал VT100. Источник: Wikipedia
3. Псевдотелетайпы или телетайпы программной эмуляции. Именно это означает термин PTS (PseudoTeleTypes). Некоторые современные примеры псевдотелетайпов включают Hyper, iTerm, Cygwin, Cmd.exe и Bash для Windows.
Возвращаясь к нашей истории, проблема заключается в том, что процесс базы данных mysql не может писать в стандартный поток, который в Alpine указывает на нулевое устройство псевдотелетайпа (pts), расположенное по адресу /dev/pts/0, разновидность телетайпа.
А ведь было бы неплохо иметь возможность пересылать журналы медленных запросов (slow_query_logs) MySQL на stdio и дальше работать сними с помощью docker-compose logs -f mysql.
Важно отметить, что в реальном production-окружении эта проблема не столь актуальна, поскольку логи из разных контейнеров, скорее всего, агрегируются с помощью драйверов для журналирования во что-то вроде Logstash, Splunk или Amazon Cloudwatch.
Менее затратной альтернативой logging-драйверам является запись slow-логов в место, подходящее MariaDB (обычный файл). Специальный Bash-скрипт может извлекать эти обычные файлы из запущенного контейнера с помощью команды копирования — docker cp.
Какой смысл, спросите вы, «убить» всю субботу и воскресенье, пытаясь направить MariaDB slow-логи в stdio вместо обычного файла или внешнего процесса? Дело в том, что это соответствует сложившейся практике.
Именно этот подход я успешно применяю в контейнерах PHP-FPM и Nginx. Он же широко используется и в сообществе, о чем свидетельствует в официальная документация Docker. Кроме того, он попросту выглядит естественным, «чистым» и простым (в духе Docker).
Хотя (в зависимости от контекста) чистота и совершенство могут являться благородной целью, это не всегда желательно или даже возможно. Можно было дальше загонять себя в тупик, пытаясь добиться вывода slow-логов в stdio ... Или можно принять альтернативное решение, которое, хотя и не так красиво, но будет работать столь же хорошо, и, наконец, вспомнить о своих выходных (от коих осталось всего несколько часов). Прекрасный компромисс, на который я, пожалуй, пойду!
habr.com
Краткое содержание:
- MySQL работает под пользователем mysql без root-прав.
- Контейнер Docker использует Alpine, само собой. А как иначе?
- Попытка сделать так, чтобы пользователи без root-прав могли записывать в /dev/stderr и /dev/stdout, похоже, провалилась.
- Впервые в 2020 году выпадает снег в Нью-Йорке (веская причина, ага).
- Пишу еще одну статью на Medium, к которой непременно вернусь в будущем.
- TL;DR: достичь желаемого результата (писать slow-логи в stdio) так и не удалось. Тем не менее, в конце статьи упомянуты некоторые альтернативы. В поисках решения рекомендую переходить сразу в конец, ибо основная часть этой истории (как обычно это бывает) посвящена именно процессу, которым я и спешу поделиться с вами.
Журналы медленных запросов важны, поскольку позволяют выяснить, является ли медленный запрос причиной подвисания приложения.
С этим мы сталкиваемся постоянно — например, когда некий умник пытается провести поиск по всем существующим записям базы данных без фильтра. Да, на MacBookPro, пока его владелец потягивает соевый skinny-латте за 10 баксов в модной кофейне в центре Бушуика в Бруклине (хмм… кого-то напоминает), это сработает, но не в production. Ведь там могут быть сотни тысяч записей, если не больше.
Обычно я загружаю production-базу в локальное окружение и запускаю приложение с включенным журналом медленных запросов. Или уговариваю команду эксплуатации включить slow-логи в stage-окружении.
Что ж, пора заканчивать со введением. Вот как MySQL жалуется на невозможность записи в /dev/stderr:
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] mysqld: Can't seek in file '/dev/stderr' (Errcode: 29 "Invalid seek")
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] Could not use /dev/stderr for logging (error 29). Turning logging off for the whole duration of the MariaDB server process. To turn it on again: fix the cause, shutdown the MariaDB server and restart it.
Примечание: хотя термины MySQL и MariaDB используются как взаимозаменяемые, в моем контейнере работает бесплатная MariaDB с открытым исходным кодом. Так что адвокаты Ларри Эллисона могут расслабиться.
В Alpine Linux писать в stdio могут только члены группы tty.
Поскольку запуск процессов под root — это зло, я попытаюсь наделить соответствующими правами других пользователей (включая того, кто запускает процесс базы данных mysqld в рассматриваемом Docker-контейнере Alpine).
Пишем в stdio без root-прав в Alpine Linux: что нужно сделать?
- Добавить пользователя без root-прав в группу tty.
- Убедиться, что tty инициализирован либо docker run, либо docker-compose.
- Проверить, что процесс Docker действительно пытается писать логи в /dev/stdout или /dev/stderr.
Эта проблема уже ранее обсуждалась на Medium. Приведенные выше шаги базируются на идеях из этого комментария на github.com:
Они вполне успешно работают для Nginx-контейнера на основе Alpine. Однако в случае аналогичного Alpine-контейнера с MariaDB писать slow-логи в /dev/stderr почему-то не получается.
Все дальнейшие шаги, предпринятые мной для анализа данной проблемы, будут подробно документированы. Это пригодится в будущем.
Если вы не являетесь поклонником жанра ужасов и фильмов о зомби, советую пропустить последующие разделы и просто пролистать до конца, ибо они изобилуют ужасными техническими подробностями.
Обеспечиваем доступ пользователя без root-прав к stdio
1. Проверяем, есть ли доступ к группе tty у пользователя mysql в Alpine
Заходим в созданный Docker-контейнер как пользователь mysql (без прав root). Именно этот пользователь запускает процесс базы данных в контейнере. Теперь надо проверить, был ли он включен в группу tty во время сборки. Для этого воспользуемся командой groups: она подтверждает, что пользователь является участником группы:docker-compose run --rm --user=mysql --entrypoint=ash mysql
/ $ groups
mysql tty
Смотрим содержимое Dockerfile:
2. Убеждаемся, что tty доступен
В конфигурации Docker Compose для службы mysql необходимо указать tty: true, чтобы гарантировать, что tty будет выделен при запуске контейнеров. По умолчанию пользователи без root-прав не могут использовать tty в Alpine при запуске с docker-compose up.Отсутствие tty оправдано, поскольку интерактивная работа с контейнером вроде как не предполагается (ведь никто в реальном времени не будет вводить команды в терминале). Скорее контейнеры будут работать в фоновом режиме самостоятельно, без прямого взаимодействия с пользователем. Однако тут есть странность: пользователю без root-прав все равно нужен tty для перенаправления вывода процесса (а, следовательно, и Docker-логов) в stdio.
3. Подтверждаем, что пользователь без root-прав может писать в /dev/stdout
Самый простой способ: зайти в контейнер как пользователь mysql и отправить что-нибудь в stdio:/ $ echo "hi" > /dev/stdout
hi
Получилось!
Все разрешения есть, но MySQL по-прежнему не пишет логи в stdio
Теперь давайте зайдем в Docker-контейнер и попытаемся запустить процесс базы данных вручную, поигравшись с параметрами.Контейнер запускается под root’ом. Именно root вызывает su-exec для запуска /usr/bin/mysqld от имени пользователя mysql, не имеющего root-прав:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/dev/stderr \
--slow-query-log
Это невозможно сделать из другого контейнера, потому что MySQL уже работает и использует тот же Docker-том, и находящиеся в нем файлы заблокированы MySQL-процессом.
Давайте остановим сервис mysql. Затем запустим отдельный контейнер и попытаемся запустить его вручную.
Отлично. Обратите внимание, что:
- флаг --user=mysql запускает процесс от имени пользователя mysql;
- --entrypoint=ash предотвращает фактический запуск mysql.
Вот ее полный текст:
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] mysqld: Can't seek in file '/dev/stderr' (Errcode: 29 "Invalid seek")
2020-01-19 9:08:10 0 [ERROR] Could not use /dev/stderr for logging (error 29). Turning logging off for the whole duration of the MariaDB server process. To turn it on again: fix the cause, shutdown the MariaDB server and restart it.
Еще несколько наблюдений
TTY по умолчанию выделяется при запуске контейнера с помощью docker-compose run. Чтобы TTY не выделялся, необходимо явно указать флаг, так что наша проблема не в отсутствии TTY.Взято из https://docs.docker.com/compose/reference/run/ :
-T Disable pseudo-tty allocation. By default `docker-compose run` allocates a TTY.
Кроме того, как говорилось выше, даже если процесс базы данных запускает пользователь без root-прав, сам контейнер работает под root при запуске с помощью docker-compose up -d. Так что tty в таком контейнере в любом случае должен присутствовать (на всякий случай я дополнительно внес в compose-файл соответствующую строку).
Код системной ошибки 29
Теперь насчет этой ошибки: Errcode: 29 "Invalid seek".Поиск по кодам системных ошибок в MariaDB не дает результата:
А как насчет прямого изменения файлов stdio?
Тоже не работает:/ # chmod o+w /dev/stdout /dev/stderr
Напомню, что у нас Alpine, и /dev/stderr — это не просто /dev/stderr. Это ссылка, которая указывает на ссылку. Да, именно это я и хотел сказать:
Что ж, проверим:
И еще одна попытка:
Увы:
Пробуем старый трюк
Этот паттерн упоминается в официальной документации Docker. В нем даже есть отсылка на официальный Dockerfile для nginx.Взято из https://docs.docker.com/config/containers/logging/ :
А вот и Dockerfile, упомянутый в официальной документации Docker. Именно этот его фрагмент относится к нашей проблеме:
Создаем ссылку:
ln -sf /dev/stderr /tmp/err.log
Попробуем еще раз, на этот раз указывая на ссылку, а не на stderr напрямую:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/tmp/err.log \
--slow-query-log
Снова пытаемся писать slow-логи в /tmp/err.log (напомню, err.log указывает на stdio). Но все равно не получается:
А вот если указать реальный файл в директории, в которую пользователь без root-прав может писать (tmp), тогда все в порядке:
su-exec mysql /usr/bin/mysqld \
--skip-name-resolve \
--skip-host-cache \
--skip-slave-start \
--debug-gdb \
--slow-query-log-file=/tmp/errordotlog \
--slow-query-log
Любопытно.
Самое время для разнообразия совершить небольшой экскурс в историю...
Что такое TTY и PTS?
На одном из приведенных выше скриншотов видно, что /dev/stdio* в Alpine Linux ссылается на файловые дескрипторы /proc/self/fd/[0-2]. Затем эти файловые дескрипторы в свою очередь ссылаются на устройство /dev/pts/0. Также упоминается, что для существования pts/0 — tty должен быть выделен Docker’ом. Но что такое tty? И что такое pts?TTY — сокращение от TeleType (телетайп). Их история гораздо богаче, чем может показаться, но достаточно разбить телетайпы на три большие исторические категории:
1. Телетайпы. Электромеханические устройства для кодирования, передачи, декодирования и печати сообщений на больших расстояниях с использованием телеграфии.
2. Телетайпы с аппаратной эмуляцией. Устройства-эмуляторы обычных телетайпов, в которых мониторы заменили обычные бумажные рулоны. Пример — Терминал VT100:
3. Псевдотелетайпы или телетайпы программной эмуляции. Именно это означает термин PTS (PseudoTeleTypes). Некоторые современные примеры псевдотелетайпов включают Hyper, iTerm, Cygwin, Cmd.exe и Bash для Windows.
Возвращаясь к нашей истории, проблема заключается в том, что процесс базы данных mysql не может писать в стандартный поток, который в Alpine указывает на нулевое устройство псевдотелетайпа (pts), расположенное по адресу /dev/pts/0, разновидность телетайпа.
Нет очевидного решения
Пока что похоже, что MariaDB не может писать лог ошибок в стандартный поток или конвейер.А ведь было бы неплохо иметь возможность пересылать журналы медленных запросов (slow_query_logs) MySQL на stdio и дальше работать сними с помощью docker-compose logs -f mysql.
Важно отметить, что в реальном production-окружении эта проблема не столь актуальна, поскольку логи из разных контейнеров, скорее всего, агрегируются с помощью драйверов для журналирования во что-то вроде Logstash, Splunk или Amazon Cloudwatch.
Менее затратной альтернативой logging-драйверам является запись slow-логов в место, подходящее MariaDB (обычный файл). Специальный Bash-скрипт может извлекать эти обычные файлы из запущенного контейнера с помощью команды копирования — docker cp.
Какой смысл, спросите вы, «убить» всю субботу и воскресенье, пытаясь направить MariaDB slow-логи в stdio вместо обычного файла или внешнего процесса? Дело в том, что это соответствует сложившейся практике.
Именно этот подход я успешно применяю в контейнерах PHP-FPM и Nginx. Он же широко используется и в сообществе, о чем свидетельствует в официальная документация Docker. Кроме того, он попросту выглядит естественным, «чистым» и простым (в духе Docker).
Хотя (в зависимости от контекста) чистота и совершенство могут являться благородной целью, это не всегда желательно или даже возможно. Можно было дальше загонять себя в тупик, пытаясь добиться вывода slow-логов в stdio ... Или можно принять альтернативное решение, которое, хотя и не так красиво, но будет работать столь же хорошо, и, наконец, вспомнить о своих выходных (от коих осталось всего несколько часов). Прекрасный компромисс, на который я, пожалуй, пойду!
MySQL в Docker не может писать slow-логи в /dev/stderr
Прим. перев. : в процессе поиска решения проблемы с логированием медленных запросов MySQL наткнулся на довольно познавательную статью. Её автор не только в деталях описывает своё расследование,...
habr.com